Biomarker-testen is van vitaal belang voor oncologisch onderzoek en klinische zorg. Het stelt ons in staat om gerichte therapie\u00ebn te ontwikkelen en gepersonaliseerde behandelingen aan te bieden. Met behulp van next-generation sequencing (NGS) kunnen we diverse genomische veranderingen in een enkel assay detecteren. Echter, de brede toepassing hiervan wordt belemmerd door de kwaliteit en hoeveelheid beschikbare tumormonsters. Het probleem van monsterkwaliteit Een blijvend probleem bij biomarker-testen is de afhankelijkheid van formalinefixeerde, in paraffin ingesloten (FFPE) weefselmonsters. FFPE is de standaard voor monstersconservering, maar het extraheren van hoogwaardig DNA en RNA voor NGS is moeilijk. Veel klinische monsters, vooral naaldbiopsie\u00ebn, leveren vaak slechts enkele nanogrammen bruikbaar materiaal op. Dr. Erin Newburn, PhD, Directeur van Field Applications bij Labcorp, benadrukt het wijdverspreide karakter van dit probleem: \u201cKlinische proefmonsters uit FFPE-blokken hebben vaak een lage nucle\u00efnezuuropbrengst en degradatie. Dit be\u00efnvloedt de extractie, bibliotheekpreparatie en post-sequencing dataverwerking.\u201d Waarde ontsluiten met geoptimaliseerde workflows en schaalbare technologie\u00ebn Om deze beperkingen het hoofd te bieden, nemen laboratoria standaardwerkprocessen over die het maximale datagebruik uit moeilijke monsters maximaliseren. Labcorp heeft geautomatiseerde dubbele extractieprotocollen ontwikkeld om de nucle\u00efnezuuropbrengst en kwaliteit uit FFPE-weefsels te verbeteren, waardoor het aantal monsters met onvoldoende hoeveelheid (QNS) wordt verminderd. \u201cGeautomatiseerde, gestandaardiseerde workflows verbeteren de nucle\u00efnezuuropbrengst en -kwaliteit significant\u201d, zegt Dr. Newburn. \u201cDit maakt succesvolle genomische profilering en uiteindelijk betere pati\u00ebntuitkomsten mogelijk.\u201d Naast extractie helpen kwaliteitscontrole (QC) metrieken om betrouwbare variantoproepen te garanderen. QC-tools filteren laagbetrouwbare gegevens en minimaliseren vals-positieve resultaten, waardoor betrouwbare gegevens worden geleverd om op basis daarvan informatieve beslissingen te nemen. Brede genomische oplossingen voor maximale inzichten Technologie\u00ebn zoals whole-exome sequencing (WES), whole-transcriptome sequencing (WTS) en grote gerichte panelen zijn een sleutelstrategie om variantdetectie te maximaliseren uit minimale input. Voegt Dr. Newburn toe: \u201cComprehensieve platforms helpen biopharma-teams om data-outputs voor huidige en toekomstige biomarkers van belang te maximaliseren uit beperkt materiaal.\u201d Beste praktijken voor succes Om uitgebreide genomische profilering (CGP) in settings met beperkte monsters te optimaliseren, is vroege afstemming met ervaren genomische aanbieders van cruciaal belang. Beste praktijken omvatten: Gestandaardiseerde extractie voor reproduceerbaarheid en schaalbaarheid QC-ge\u00efnformeerde bibliotheekpreparatie om de gegevenskwaliteit te verbeteren en herwerkzaamheid te verminderen Geavanceerde sequencingplatforms die inzichten leveren uit monsters met lage input Deze benaderingen verbeteren uitkomsten, versnellen tijdlijnen en verminderen kosten \u2013 cruciaal in klinische en onderzoeksomgevingen. Casusstudies: Het mogelijk maken van hoogbetrouwbare variantdetectie voor uw biomarker-gebaseerde proef Toestemming verleend door Labcorp Op het moment dat CGP integraal wordt voor oncologische ontwikkeling, is het genereren van betrouwbare gegevens uit beperkte monsters essentieel. Door innovaties in extractie, sequencing en analyse helpt Labcorp om het volledige potentieel van precieze oncologie te ontsluiten, \u00e9\u00e9n monster per keer. Partner met Labcorp om uw oncologieproeven te versnellen met schaalbare, precieze oplossingen. Bronnen 1 Hedegaard J, Thorsen K, Lund MK, et al. PLoS One. 2014;9(5):e98187. doi:10.1371\/journal.pone.0098187 2 Spencer DH, Sehn JK, Abel HJ, Watson MA, Pfeifer JD, Duncavage EJ. J Mol Diagn. 2013;15(5):623-633. doi:10.1016\/j.jmoldx.2013.05.004 3 McDonough SJ, Bhagwate A, Sun Z, et al. PLoS One. 2019;14(4):e0211400. doi:10.1371\/journal.pone.0211400 4 Amirault K, Collins M, Beker L, et al. SLAS Technol. 2025;31:100252. doi:10.1016\/j.slast.2025.100252 5 Do H, Dobrovic A. Clin Chem. 2015;61(1):64-71. doi:10.1373\/clinchem.2014.223040 6 An J, Collins MJ, DeBlasi EA, et al. Gepubliceerd 23 november 2024 https:\/\/oncology.labcorp.com\/analytical-validation-omniseqr-insight-whole-exome-sequencing-assay-facilitate-precision-oncology 7 Gegevens op bestand, Labcorp Gecategoriseerd onder: Klinische proeven<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Biomarker-testen is van vitaal belang voor oncologisch onderzoek en klinische zorg. Het stelt ons in staat om gerichte therapie\u00ebn te ontwikkelen en gepersonaliseerde behandelingen aan te bieden. Met behulp van next-generation sequencing (NGS) kunnen we diverse genomische veranderingen in een enkel assay detecteren. Echter, de brede toepassing hiervan wordt belemmerd door de kwaliteit en hoeveelheid … Lees verder<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":0,"featured_media":69797,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[684],"tags":[],"class_list":["post-69796","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-nouvelles-pharmaceutiques"],"amp_enabled":true,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/69796","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=69796"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/69796\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":69806,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/69796\/revisions\/69806"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/media\/69797"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=69796"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=69796"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=69796"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}