Als apotheker zie ik dagelijks hoe belangrijk het is dat wetenschappers snel en betrouwbaar gegevens kunnen verzamelen om betere medicijnen en behandelingen te ontwikkelen. Een techniek die hieraan bijdraagt, is *single-cell transcriptomie*. Deze methode onderzoekt niet de gemiddelde activiteit van genen in een groep cellen (zoals bij traditionele RNA-sequencing), maar kijkt naar de unieke kenmerken van *iedere individuele cel*. Dit is cruciaal voor het begrijpen van complexe processen in het lichaam, bijvoorbeeld bij kanker, immunologie, cel- en gentherapie (CGT) en meer. Zo kunnen onderzoekers ontdekken hoe verschillende cellen reageren op medicijnen of ziektes, wat in bulk-analyses vaak verborgen blijft. Dit geeft een veel gedetailleerder en nauwkeuriger beeld dan voorheen mogelijk was. <\/p>\n
Helaas zijn traditionele single-cell workflows vaak tijdrovend en arbeidsintensief. Zo kan een onderzoeker met de hand nog maar ongeveer 24 monsters per dag verwerken. Dit vertraagt grootschalige projecten en maakt het moeilijk om grote aantallen monsters te analyseren. Om dit te verbeteren, werken wetenschappelijke bedrijven samen aan geautomatiseerde oplossingen die het werk sneller, eenvoudiger en betrouwbaarder maken. <\/p>\n
Een goed voorbeeld hiervan is de samenwerking tussen **Beckman Coulter Life Sciences** en **10x Genomics**, die sinds 2023 werken aan het automatiseren van het *library preparation*-proces voor single-cell transcriptomie. Dit proces is essentieel om de genactiviteit in cellen te meten, maar vereist tot nu toe veel handmatig werk en nauwkeurige temperatuurbeheersing. Met automatisering willen ze deze stappen versnellen en de kwaliteit van de resultaten verbeteren. <\/p>\n
Een contractonderzoeksorganisatie (CRO) genaamd **Single Cell Discoveries (SCD)** uit Nederland werkte samen met deze bedrijven om hun workflow te automatiseren. Voorheen kostte het voorbereiden van 24 monsters per dag meer dan vijf uur handmatig werk. Nu kunnen ze met automatisering tot wel **96 monsters per dag** verwerken, terwijl de benodigde handarbeid terugliep van ruim vijf uur naar slechts \u00e9\u00e9n uur. Dit betekent niet alleen een enorme tijdsbesparing, maar ook minder fouten. Robots maken immers zelden pipetteerfouten, terwijl mensen dat wel eens kunnen doen. Zo wordt het eindresultaat consistenter en betrouwbaarder. <\/p>\n
De voordelen van automatisering gaan nog verder. Zo wordt er ook gewerkt aan het automatiseren van andere stappen, zoals *cDNA-synthese* (het omzetten van RNA in DNA voor analyse) en het meten van eiwitten op het oppervlak van cellen. Daarnaast wordt er gewerkt aan geavanceerdere technieken, zoals *VDJ-profilering*, waarmee onderzoekers immuuncellen (zoals T- en B-cellen) op celniveau kunnen analyseren. Dit kan leiden tot betere immunotherapie\u00ebn tegen kanker en andere ziektes. <\/p>\n
Voor de ontwikkeling van medicijnen is deze techniek ook goud waard. Single-cell transcriptomie helpt ons te begrijpen hoe medicijnen werken op *alle verschillende celtypes* in het lichaam, inclusief bijwerkingen en werkingsmechanismen. Dit soort gedetailleerde kennis kan leiden tot veiliger en effectiever medicijnen. <\/p>\n
Deze automatisering maakt single-cell transcriptomie toegankelijker en effici\u00ebnter, net zoals *next-generation sequencing* (een andere revolutionaire techniek) eerder deed. Waar deze technieken eerst alleen in gespecialis<\/a>eerde laboratoria werden gebruikt, worden ze nu steeds meer mainstream. Door samenwerking tussen CRO\u2019s, technologische bedrijven en farmaceutische ontwikkelaars kunnen onderzoekers straks nog sneller en met meer precisie antwoord krijgen op belangrijke vragen. Dit brengt ons dichter bij persoonlijkere en effectievere behandelingen voor pati\u00ebnten. <\/p>\n Kortom: automatisering is de sleutel tot het ontsluiten van het volledige potentieel van single-cell transcriptomie. Het maakt deze krachtige technologie sneller, nauwkeuriger en toegankelijker \u2013 en dat is goed nieuws voor de wetenschap *en* voor de gezondheid van pati\u00ebnten.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Als apotheker zie ik dagelijks hoe belangrijk het is dat wetenschappers snel en betrouwbaar gegevens kunnen verzamelen om betere medicijnen en behandelingen te ontwikkelen. Een techniek die hieraan bijdraagt, is *single-cell transcriptomie*. Deze methode onderzoekt niet de gemiddelde activiteit van genen in een groep cellen (zoals bij traditionele RNA-sequencing), maar kijkt naar de unieke kenmerken … Lees verder<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":0,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[684],"tags":[],"class_list":["post-70403","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-nouvelles-pharmaceutiques"],"amp_enabled":true,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/70403","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=70403"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/70403\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":70413,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/70403\/revisions\/70413"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=70403"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=70403"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.apotheek-erica.nl\/online\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=70403"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}