Onderzoekers van Imperial College London hebben een innovatieve techniek ontwikkeld, genaamd EDEN (Enhanced Domestication), die het mogelijk maakt om meer bacteriën in het laboratorium te kweken. Dit is een belangrijke vooruitgang, omdat traditionele methoden vaak falen: tot wel 99% van alle bacteriën blijft dan onbekend. Deze bacteriën zouden nieuwe nuttige stoffen kunnen bevatten, zoals antibiotica die resistente bacteriën kunnen bestrijden.
Hoe werkt het? Onderzoekers gebruikten een speciaal 3D-geprint apparaat met doorstromingstechnologie, een zogenaamde continu-flow kweekplaat. Deze plaat zorgt ervoor dat bacteriën geleidelijk wennen aan een nieuw voedingsmedium, zonder dat ze een ‘voedingsstofschok’ oplopen. Dit gebeurt door de blootstelling aan plotselinge veranderingen in voedingsstoffen en omgevingsomstandigheden te minimaliseren. Zo konden onderzoekers een drie keer grotere verscheidenheid aan bacteriën kweken dan met traditionele methoden. Ook werden er tien keer meer zeldzame, mogelijk nog niet eerder gekweekte bacteriën gevonden.
De onderzoekers slaagden erin om met deze methode een nieuwe bacteriesoort te isoleren die sterke antibiotische eigenschappen heeft tegen resistente ziekmakende bacteriën. Daarnaast bleek de EDEN-techniek de kweekbaarheid van bacteriën in agarose-ingekapselde microkolonies te verdubbelen. Het 3D-printproces van de kweekplaten was bovendien efficiënter dan handmatige methoden, omdat het geen gebruik maakte van lijm of andere stoffen die mogelijk slecht voor de bacteriën zijn.
In de toekomst zou de EDEN-methode ook gebruikt kunnen worden voor het kweken van bepaalde schimmels, als een bioreactor voor doorstroming of in combinatie met geautomatiseerde systemen om snel nieuwe bacteriën te onderzoeken. Dit zou kunnen leiden tot de ontdekking van nieuwe geneesmiddelen, waaronder antibiotica. Het onderzoek is gepubliceerd in het wetenschappelijke tijdschrift ISME Communications.
Daarnaast blijkt uit ander onderzoek dat het verbeteren van microbiologische testen door vochtproblemen tegen te gaan, zoals condens op schaaltjes, ook van belang is. Dit kan de betrouwbaarheid van testresultaten vergroten.